Após os eventos de Sonic 2: O Filme, Knuckles, o equidna vermelho e temperamental, encontra-se em um mundo desconhecido e cheio de desafios. Na Terra, ele se depara com a missão de orientar Wade Whipple, o vice-xerife de Green Hills, que aspira a ser mais do que apenas um oficial da lei. Juntos, eles embarcam em uma jornada hilária e repleta de ação, onde Knuckles ensina Wade as antigas artes marciais dos equidnas e o verdadeiro significado de ser um herói.