Yakitori: Soldados do Desastre é baseada nos livros de ficção científica do autor Carlo Zen. A trama acompanha o jovem Akira Ihotsu, que mora no planeta Terra do Futuro, onde todas as regras são ditadas por uma organização conhecida como Shoren. Apesar de estar insatisfeito com a opressão do governo, Akira acaba envolvido com a organização após ser chamado para fazer parte da Yakitori, força de infantaria que patrulha a órbita do planeta. Porém, as missões extremamente violentas da equipe contam com uma taxa de 70% de mortes. Para mudar seu destino, Akira vai precisar se unir a outros jovens da equipe.